基于ITS2序列的蓼属药用植物及其近缘种DNA分子鉴定开题报告

 2022-12-30 09:57:56

1. 研究目的与意义

一、内容采集杠板归、红蓼等蓼属药用植物及其近缘种的样品,分别提取其基因组总DNA,通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序;从GenBank下载蓼属植物种条序列,并通过ITS2数据库注释出ITS2序列;对所测和下载的条序列应用MEGA7.0软件进行序列比对,计算种内和种间距离,采用相似性搜索法、最近距离法进行鉴定分析,并构建neighber-joining (NJ) 系统进化树直观反映鉴定结果。

二、意义在我国,广义的蓼属(Polygonum L.)植物有113种26变种,分布于全国各省。

该属是蓼科中药用植物种类最多的属,共81种供药用。

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2. 文献综述

蓼属药用植物的研究进展摘要:蓼属植物是蓼科中药用植物种类最多的属。

其化学成分主要含黄酮类、醌类、苯丙素类、萜类等,具有抗氧化、抗肿瘤、抗炎、止痛、抗菌、杀虫等药理作用。

蓼属植物形态较为相似,花、果实很小,不易鉴别和区分,容易造成临床上的误用与混用,故对其进行准确的基原鉴定尤为重要。

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3. 设计方案和技术路线

一、研究方案1.查阅文献,了解ITS2技术用于药用植物鉴定的方法,通过预试验确定ITS2技术用于蓼属植物鉴定的实验条件。

2.采集杠板归、红蓼等蓼属药用植物及其近缘种的样品,分别提取其基因组DNA,通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序。

3.从GenBank下载蓼属植物种条序列,并通过ITS2数据库注释出ITS2序列;对所测和下载的条序列应用MEGA7.0软件进行序列比对,计算种内和种间距离,采用相似性搜索法、最近距离法进行鉴定分析,并构建neighber-joining(NJ)系统进化树直观反映鉴定结果。

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4. 工作计划

2022年1月6日2022年2月5日查阅文献,了解蓼属植物的主要化学成分、药理作用、分类鉴别研究等。

2022年2月5日2022年3月10日根据所查阅的文献,完成开题报告和文献综述;收集实验样品、购买试剂、预约仪器设备,为实验做好准备。

2022年3月10日2022年3月底开展实验研究内容,做好实验记录和进行实验结果分析。

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5. 难点与创新点

1.虽然国内外学者对蓼属植物进行了广泛的研究,但主要集中于化学成分及药理活性方面。

在分类鉴定方面,也有一些学者从系统分类的角度研究部分蓼属植物不同种类间的系统学意义,采用传统和分子生物学的鉴定方法对中药材进行鉴定方法,而基于DNA条形码技术(ITS2)对蓼属药用植物及其近缘种的分子鉴定研究鲜见报道。

2.基于核酸序列分析的鉴定技术是一种新的分子鉴定技术,与传统的物种鉴定方法和基于PCR或基于分子杂交的DNA分子鉴定技术相比,具有操作简单、准确性高、效率高、不受被鉴定对象的环境及个体发育和人为因素影响等优点。

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