基于多模型的信息素诱导型启动子活性预测开题报告

 2023-04-18 09:34:30

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

文 献 综 述1.1 酿酒酵母启动子工程启动子是控制蛋白质表达定量和时间调控的基本转录调控元件,启动子水平的转录调控是调节代谢通量的最直接有效的方法1,在调控遗传回路和代谢途径的基因表达中发挥着重要作用,被广泛应用于生物传感器和代谢工程。

目前,启动子工程的研究方法主要包括非保守序列随机化、易错PCR、合成型启动子工程、理性设计转录因子结合位点(Transcription factor-binding sites,TFBSs)、启动子与RBS组合等。

然而,酵母自身的启动子存在着一些局限性,阻碍了其在代谢工程中的应用1,2。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

一、 研究内容启动子是位于上游DNA序列结构基因的5'端片段,是参与基因表达调控的关键元件。

信息素诱导性启动子在基因线路和代谢途径的微观调节方面的应用由于表征数据不足等劣势而被限制。

将计算机分析预测方法融入生物学研究是一种有效的手段,卷积神经网络模型现已广泛的应用于分子生物学领域,包括但不限于对启动子的优化和构建,而隐马尔可夫模型也已经广泛应用于基因启动子的识别等领域。

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