化学交联解析蛋白质构象开题报告

 2022-12-28 10:22:48

1. 研究目的与意义

内容:本次设计以溶菌酶为研究对象,采用胺类交联剂二(磺基琥珀酸酰亚胺)辛二酸(BS3)为交联试剂对其结构进行研究。

通过对蛋白质变性时间长度的控制,利用质谱技术,考察溶菌酶二硫键逐步打开后构象的变化。

意义:研究蛋白质的空间结构信息及其相互作用对于了解蛋白质的功能具有重要意义。

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2. 文献综述

化学交联解析蛋白质结构的研究摘要:研究蛋白质的空间结构信息及其相互作用对于了解蛋白质的功能具有重要意义。

化学交联剂是能够和蛋白质反应的带有双功能团的化学试剂。

通过功能团和氨基酸残基反应,偶联两个蛋白质或者更多的蛋白质形成网状交联[1]。

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3. 设计方案和技术路线

研究方案:1.配制反应试剂2.蛋白变性加入尿素破坏氢键,再加入DTT打开二硫键,最后加入IAA还原烷基化。

3.超滤4.交联反应加入交联剂进行交联反应,反应完成后加入终止剂5.超滤6.酶解20h7.挥干8.除盐9.离心取上清液,进入质谱分析10.数据分析技术路线:见附录1

4. 工作计划

2.10-2.28查阅并整理文献资料2.28-3.12 完成开题报告3.12-5.31 进行课题实验6.1-6.10完成毕业论文设计

5. 难点与创新点

(1) 被分析蛋白质或蛋白质复合体的分子量( molecular weight, MW) 从理论上说是无限的;(2)质谱分析速度十分迅速, 可以极大缩短分析时间; (3)质谱检测灵敏度极高, 被分析的蛋白质只需飞摩尔 (femtomole) 级的量就可满足实验要求; (4)易于获得溶液中蛋白质三维结构信息, 并可鉴定出蛋白质的可变结构域;(5)化学交联法结合质谱法在膜蛋白研究领域的应用与其他传统方法相比有其独特的优势,若采用膜透性的交联剂时,也可以进行体内的分析。

(6)能够动态的捕捉到某个状态下的微弱的、瞬时的相互作用。

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