十倍体长穗偃麦草核型分析开题报告

 2023-02-18 22:16:55

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

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2. 研究的基本内容和问题

小麦近缘种含有许多与抗病、抗逆、丰产、优质等有关的优良基因,是小麦改良的巨大基因库。利用染色体工程技术,将这些基因导入到栽培小麦品种中,是当前增加小麦遗传多样性、进行小麦遗传育种的主要手段之一。十倍体长穗偃麦草(Thinopyrum ponticum)(2n10x70)是小麦(Triticum aestivum)重要的三级基因源,具有小麦改良所需要的多种优异性状,是小麦改良中应用的较为广泛的一个多年生异源十倍体种。但是,由于十倍体长穗偃麦草的染色体组成复杂,因此迄今为止尚缺乏高清核型。本研究基于寡核苷酸探针FISH,了解不同重复序列在长穗偃麦草染色体上的分布特点,鉴定用于染色体识别的探针,并构建参考核型,为通过染色体工程转移和利用其有利基因提供便利。

小麦近源种含有许多与抗病、抗逆、丰产、优质等有关的优良基因,是小麦改良的巨大基因库。利用染色体工程技术,将这些基因导入到栽培小麦品种中,是当前增加小麦遗传多样性、进行小麦遗传育种的主要手段之一。十倍体长穗偃麦草(Thinopyrum ponticum)(2n10x70)是小麦(Triticum aestivum)重要的三级基因源,具有小麦改良所需要的多种优异性状,是小麦改良中应用的较为广泛的一个多年生异源十倍体种。但是,由于十倍体长穗偃麦草的染色体组成复杂,因此迄今为止尚缺乏高清核型。本研究基于寡核苷酸探针FISH,了解不同重复序列在长穗偃麦草染色体上的分布特点,鉴定用于染色体识别的探针,并构建参考核型,为通过染色体工程转移和利用其有利基因提供便利。

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3. 研究的方法与方案

本研究前期已经通过tem repeat analyzer (TAREAN)将百萨偃麦草的二代基因组测序数据进行聚类,获得了19个重复序列,部分重复序列经过FISH验证在二倍体长穗偃麦草、百萨偃麦草、中间偃麦草中均有分布,因此可以作为核型分析的基础。同时,本研究准备将十倍体长穗偃麦草进行基因组测序,通过TAREAN对十倍体长穗偃麦草的重复序列进行分析,希望能够得到更多的重复序列。

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4. 研究创新点

本研究基于Oligo-painting的方法,结合生物信息学分析,对十倍体长穗偃麦草进行核型分析。

5. 研究计划与进展

2018.9-2018.12 实验技能的掌握

2019.1-2019.3 采用荧光原位杂交对重复序列的分布进行验证

2019.4-2019.5 整理实验数据,准备毕业论文的撰写
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